海南矿业股份有限公司党委下设二级党组织5个(其中：党委3个，直属党支部2个)，三级党委8个，党支部39个。截止2023年5月，党员总数1283人。
海南矿业党委始终坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，坚持党的领导，认真贯彻落实党的路线方针政策，落实海南省委、省国资委党委的各项工作部署，切实发挥党委"把方向、管大局、保落实"的政治引领作用，全面加强党的思想建设和组织建设，保持政治思想教育和党组织机构全覆盖，把党建工作贯穿于企业生产运营与企业发展建设之中，通过卓越党建引领，赋能企业发展，实现相互促进相互提升，推动企业可持续高质量发展。
海南矿业股份有限公司工会委员会(简称海矿工会) 属海南省机械能源石化医药工会，二级工会组织5个，三级工会组织38个，专兼职工会干部9人，职代会职工代表138人;现有会员2626人，职工入会率达99%以上。同时，海矿工会设立经费审查委员会和女职工委员会。
海矿工会在公司党委的领导下，坚持党建带工建，工建促党建提升组织凝聚力、战斗力。海矿工会不断强化以"职代会"制度为核心的民主管理工作，以劳模创新工作室为平台，围绕生产经营实际广泛开展劳动和技能竟赛，推进专业技术人才和先进典型培养工作;持续开展"爱心助学""大病救助""职工医疗互助"等员工关怀活动，开展丰富的文体活动，致力提升广大员工的收获感、幸福感和归属感。
共青团海南矿业股份有限公司委员会下设直属公司总部机关团支部和1个二级团委(石碌铁矿分公司团委)，其中，石碌铁矿分公司团委下设生产辅助团支部和生产团支部。公司团委现有团员90人，管理35周岁以下青年314人。
公司团委结合公司实际和青年特色，为公司青年员工搭建成长平台，开展一系列丰富多彩的青年活动，一批有理想、有专业、有激情、有朝气的年轻人走到企业管理的前台。
